Die ältesten Teile der Deutschhauskirche, der spätromanische Turm und die so genannte Taufkapelle, reichen in das frühe 13. Jh. zurück. Später wurde sie zu einer spätgotischen einschiffigen Anlage erweitert. Im frühen 18. Jh. wurde die Kirche durch den Ordensbaumeister Franz Keller (1682-1724) und seinen Bruder Johann Michael (1687-1735) barockisiert. Der Neubau mit seinen drei Altären wurde 1721 vom Würzburger Weihbischof konsekriert. Nach weitgehender Zerstörung im Zweiten Weltkrieg wurde die katholische Pfarrkirche St. Petrus und Paulus in vereinfachter Form 1949/51 wieder aufgebaut und seitdem renoviert und umgebaut.
Ältester bekannter Bauteil der Kirche ist der Spätromanische Chorturm im Süden. Der zugehörige, möglicherweise basilikale Schiffbereich ist nicht mehr vorhanden. In gotischer Zeit wurde nördlich neben der romanischen Anlage ein neuer Kirchenbau errichtet. Der Chorturm ist in diese Anlage als südliche Seitenkapelle miteinbezogen worden. Der Kirchenbau ist 1721 im Zusammenhang mit dem schlossartigen Ausbau des Deutschhofs verändert worden. Aus dieser Zeit stammt die barocke Westfassade. Der Bau war im 2. Weltkrieg stark beschädigt und ist 1949-51 wiederaufgebaut worden.
1994 waren im Zuge der Erneuerung der Heizanlage verschiedene Öffnungen im Fußbodenbereich gemacht worden. Hierbei wurden verschiedene Fundamentmauerwerke aufgedeckt.

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